经营不善公司倒闭的员工工资应采取下列方式进行处理：劳动者可以及时向清算组申报债权。且申报成功的，公司在清偿债务时，会优先清偿所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用等。法律依据：《
中华人民共和国企业破产法》第四十八条
债权人应当在人民法院确定的债权申报期限内向管理人申报债权。
债务人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金，不必申报，由管理人调查后列出清单并予以公示。
职工对清单记载有异议的，可以要求管理人更正；管理人不予更正的，职工可以向人民法院提起诉讼。
第四十九条
债权人申报债权时，应当书面说明债权的数额和有无财产担保，并提交有关
证据。
申报的债权是连带债权的，应当说明。
