2003年4月30日,国家食品药品监管局转发《国务院办公厅关于印发国家食品药品监督管理局主要职责内设机构和人员编制规定的通知》。《通知》明确了国家食品药品监管局的职责调整、主要职责、内设机构和人员编制等。
国家食品药品监管局是根据第十届全国人民代表大会第一次会议批准的国务院机构改革方案和《国务院关于机构设置的通知》,在国家药品监管局基础上组建的,是国务院综合监督食品、保健品、化妆品安全管理和主管药品监管的直属机构。