1、非婚生子女关系认定的难点主要在于“鉴定”。实践中，经常出现父亲在世时不配合亲子鉴定、父亲去世后无法鉴定的情形。

2、非婚生子女不适用“亲子关系推定原则”

（1）“亲子关系推定原则”，建立在主张方提供初步必要证据的前提之下，且只限定在父母子女之间，并不适用于兄弟姐妹及其他家庭成员，更不适用非婚生子女。

（2）婚生子女没有配合非婚生子女进行亲子鉴定的义务，更不适用亲子关系推定规则。