公司规定迟到30分钟，缺勤的公司规定迟到39分钟，扣除本月的全勤奖励，当天在公司上班的规定合法吗

1、不属于旷工，除非属于《劳动法》第四十二条的限制例外规定的情形；　　
2、用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后才可以延长工作时间，且延长的工作时间受法律限制；　　
3、法律依据：　　1）《劳动法》　　第四十一条　【工作时间延长限制】用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。　　2）《劳动法》第四十二条　【限制的例外】有下列情形之一的，延长工作时间不受本法第四十一条规定的限制：　　
（一）发生自然灾害、事故或者因其他原因，威胁劳动者生命健康和财产安全，需要紧急处理的；　　
（二）生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障，影响生产和公众利益，必须及时抢修的；　　
（三）法律、行政法规规定的其他情形。

按照国家规定一个月的工作日是
21.75天。
按照《劳动法》第五十一条的规定,法定节假日用人单位应当依法支付工资,即折算日工资、小时工资时不剔除国家规定的11天法定节假日。
按照1995年实施的我国劳动法的规定是44小时每周。（第36条，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。周法定工作时间为44小时。）
但随后出台的《国务院关于职工工作时间的规定》的实施办法第三条，职工每日工作8小时、每周工作40小时。国务院关于职工工作时间的规定是每周工作40小时，最迟应当于1997年5月1日起施行。从法律的规定来说,劳动法的规定44小时/周是法定的。

劳动者和用人单位建立劳动关系，劳动者旷工一天扣三天工资是不合法的，除非员工旷工给用人单位造成了经济损失，否则是不能扣款的，用人单位不需要支付当天的工资。　　《工资支付暂行条例》　　第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。　　第十八条各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有下列侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金：　　
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；　　
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资的；　　
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的。　　经济补偿和赔偿金的标准，按国家有关规定执行。　　第十九条劳动者与用人单位因工资支付发生劳动争议的，当事人可依法向劳动争议仲裁机关申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。