我们单位工资拖欠2个月了，现在要一次性发两个月的工资，必须合并扣个税吗

需要具体情况具体分析。比如，公司拖欠工资可以直接去法院起诉么？
一、在有书面欠条且不涉及其他争议的情况下，员工可以直接向法院起诉要求支付拖欠的工资。

法律依据：《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释
(二)》第三条明确规定

”劳动者以用人单位的工资欠条为证据直接向人民法院起诉，诉讼请求不涉及劳动关系其他争议的，视为拖欠劳动报酬争议，按照普通民事纠纷受理。“

注意：除追索有书面欠条的工资外，如果员工与公司之间还有其他争议，如追索一次性经济补偿金、伤亡赔偿金、要求解除或恢复劳动关系等，则不能直接向法院起诉。

二、 在用人单位拖欠工资且未有书面欠条的情况下，劳动者要先和用人单位协商，如果协商无法解决，则可以通过以下法律途径来解决：

（1）向当地劳动保障监察机构投诉举报；

（2）当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解;调解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

解决单位拖欠工资的方法可以是通过劳动争议仲裁、要仲裁的话，你必须证明你们之间的劳动关系。你可以要求你的单位出示你们的工资条或者花名册等等。下面就由法律快车的编辑为您介绍。 　　
1、可以去你的单位当地的劳动争议仲裁委员会要求仲裁。仲裁会裁决你的公司支付你的工资，你并可以要求一定的经济补偿。 　　
2、根据我国劳动合同法规定，用人单位须在一个月内与劳动者签订劳动合同。超过一个月没有签订的，要从一个月开始支付直至一年的每个月双倍工资。超过一年未予签订的，视为已经签订无固定期限劳动合同。你单位这种情况要支付你的每个月双倍工资，你同意可以去你的单位当地的劳动争议仲裁委员会要求仲裁。 　　
3、要仲裁的话，你必须证明你们之间的劳动关系。你可以要求你的单位出示你们的工资条或者花名册等等(法律规定，单位有义务出示，负责要承担不利责任)，也可以请你的工友们做你的证人来提高证人证言。也可以出示你在工作时的文书、文件、工牌、工装等等来证明。

1、用人单位不得拖欠劳动者工资，也就不存在拖欠工资不得超过多长时间的问题。
2、劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。你需要把握好这个时效。
3、建议你跟老板协商，协商不成可以申请劳动仲裁，要求支付双倍工资，补交社保 。前提是你要有能证明劳动关系和时间的证据，比如工资条（这个最重要）、工作证、考勤记录、证人证明等。