如果男方有外遇，在外和别人同居，而不回家，和我分居两年，然后上诉和我离婚，我如果不同意离婚，法院会怎么判决？

夫妻因感情不和分居满二年，一般来说可以构成夫妻感情破裂的事实证明。“分居”是指夫妻间不再共同生活，不再互相履行夫妻义务，包括停止性生活，经济上不再合作，生活上不再互相关心、互相扶助等。
具有分居二年的情形，说明夫妻关系已徒具形式，名存实亡。当事人以此事由诉请人民法院离婚的，如经调解无效，应准予当事人离婚。　　适用此项规定，应注意以下问题：　　①分居的原因是由于夫妻感情不和，而不是因工作、学习等原因导致的两地分居，以及因住房问题造成的夫妻不能同室而居。
　　②分居强调的是夫妻双方互不履行夫妻义务，而不是单方面的不履行家庭义务。　　③夫妻分居已满二年，但未造成夫妻感情确已破裂或经调解尚有和好可能的，则不能认为已具备准予离婚的条件。
　　④夫妻分居与否、分居是否满二年，都不是当事人诉请离婚的必要条件。如果夫妻感情确已破裂，调解无效的，虽无分居事实或分居未满二年，也应依法准予离婚。

1、夫妻分居两年以上，属于法定的可离婚情形，你可以要求起诉离婚。
2、夫妻关系存续期间的收入属于夫妻共同财产，供养女方及其弟弟读书，应视为夫妻双方对弟弟的赠与，与协商支付女方补偿款无关。
3、主张有夫妻共同债务的，主张一方承担举证责任，并要说明这些债务用于了夫妻共同生活开支。
4、如你所述情况属实，是可以起诉离婚的，大概时间3-6个月。

关于孩子的抚养权，双方可以首先就抚养权归属进行协商，协商不成起诉的，两岁以下婴幼儿的，一般归女方抚养，除非女方确实无抚养能力，或者确实不适宜抚养孩子的情况，譬如吸毒、服刑等等。　　孩子的抚养权，双方可以就孩子的抚养权归属做协商，协商不成的，法院依据究竟由谁来抚养孩子对于孩子的成长比较有利作出判决。如你想争取孩子的抚养权，可以举证证明有更多的时间照料孩子，孩子跟随你生活对于孩子本身成长比较有利来进行争取。　　《最高人民法院关于人民法院审理离婚案件处理子女抚养问题的若干具体意见》　　
1、两周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活：　　
(1)患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的;　　
(2)有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的;　　
(3)因其他原因，子女确无法随母方生活的。　　
2、父母双方协议两周以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。　　
3、对两周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑：　　
(1)已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的;　　
(2)子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的;　　
(3)无其他子女，而另一方有其他子女的;　　
(4)子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。　　
4、父方与母方抚养子女的条件基本相同，双方均要求子女与其共同生活，但子女单独随祖父母或外祖父母共同生活多年，且祖父母或外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或外孙子女的，可作为子女随父或母生活的优先条件予以考虑。　　
5、父母双方对十周岁以上的未成年子女随父或随母生活发生争执的，应考虑该子女的意见。　　
6、在有利于保护子女利益的前提下，父母双方协议轮流抚养子女的，可予准许。