综合计算工时制计算加班工资是：工作日加班工资标准=劳动合同规定的月工资标准÷（月计薪天数21.75×8小时）×150%;休息日加班工资标准=劳动合同规定的月工资标准÷（月计薪天数21.75×8小时）×200%;法定休假日加班工资标准=劳动合同规定的月工资标准÷（月计薪天数21.75×8小时）×300%。
法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条
有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
二、加班工资要扣税吗加班工资要扣税，加班工资属于员工正常的薪资，并不属于国家统一规定的免税项目，所以加班费应当计入个税起征点，即并入当月的工薪收入的个人所得税，进行依法纳税。
找法网提醒您：根据《个人所得税法》第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
三、加班工资和绩效工资有什么区别加班费和绩效工资不一样，两者的产生的条件是不一样的。加班费产生的条件是在规定的劳动时间之外予以加班，而后者的话，它是平时的工作所产生的工资。加班费的基数基数“按劳动合同规定的标准”，系指劳动合同规定的劳动者本人所在的岗位(职位)相对应的工资标准。对于绩效工资是否应当计算加班工资基数，因为各个单位绩效工资的计算办法不同，一般而言，绩效工资是劳动者正常劳动时间收入的组成部分的，应当作为计算基数;反之，则不应作为计算基数。
