三方协议与劳动合同的相同点是都具有协议的性质，都是平等主体之间达成合意后签订的书面文书。二者还存在如下区别：
1.主体不同。三方协议书的主体是毕业生、用人单位和学校。而劳动合同只有劳动者和用人单位两个主体。
2.依据不同。三方协议书依据的是教育部颁发的部门规章，劳动合同依据的是《劳动法》和《民法典》。
3.签订时期不同。三方协议诉一般在学生毕业前签订，正式签订劳动合同只有等到毕业后方可。
4.效力不同。三方协议书其效力始于签订之日，终于毕业生与用人单位签订劳动合同之时。劳动合同的有效期，是劳动者与用人单位以合同方式确定的，除法律规定的情形外，双方不得随意变更、中止。
二、三方协议签订要注意什么三方协议签订要注意如下细节：
1.大学生签三方协议首先要看填写的用人单位名称是否与单位的有效印鉴名称一致，如不一致，协议无效；填写自己的专业名称时，要与学校教务处的专业名称一致，不能简写。
2.现行的毕业生就业协议属“格式合同”，但“备注”部分允许三方另行约定各自的权利义务。为了防止用人单位承诺一套、做一套，毕业生可将签约前达成的休假、住房、保险等福利待遇在备注栏中说明，如发生纠纷，可以此维护自己合法权利。
三、签署三方协议后可以不任职吗签署三方协议后可以不任职，但是需要按照协议的约定办理解约手续。最好是第一时间和公司协商，看是否需要缴纳违约金，然后按以下流程办理解约手续∶
1.用人单位开据解除协议书证明。
2.填写毕业生违约申请表并由辅导员、学院相关领导审核签字。
3.持解除协议证明、已签订的就业协议书（4份）、违约申请表到学校毕业生就业指导中心办理解除协议手续。
4.经学校毕业生就业指导中心审核，5个工作日后办理新的协议书。
找法网提醒，如果违约金的金额太高，高出合理范围，可以去法院提诉，通过诉讼的方式降低违约金金额。
