一方不愿意离婚分居两年可以判离婚。
共同生活是夫妻双方的基本权利和义务，如果长期不在一起生活，夫妻关系只是名分。因此，法律规定因感情不和分居满两年，法院应当准予离婚。但是，要注意，必须是因为感情不和导致分居，并且满2年的时间，法院才会予以判离。
法院认定夫妻分居的条件有三个：
1.夫妻分居，包括因感情不和而导致的不在一处居住，不履行夫妻之前的权利、不过夫妻性生活。当然以上事实要用证据证实，或对方承认。如果只有一方另行租房的租赁合同，或是夫妻同在一个屋檐下、一套房子住、事件中是不是分床不好说清，法院也不好认定为分居。
2.分居的原因是因感情不和。有些情况下，很难说清分居是不是因为感情不和。因此，必须收集其他相关证据是的法院确信感情不和的因素存在才可以判离。当然实践中，这是困难的。
3.分居已满两年。从可以证实已经分居的事件开始算起，到起诉时已满2年，才可以构成法定判离的因素。
二、分居两年离婚的证据有哪些分居两年离婚的证据分别有：
1.有一方向另一方发出的书面分居文书，最好是用快件性质邮寄，在备注栏里注明“分居”，并且保留邮寄凭证，从邮寄之日起到提起离婚期间属于夫妻分居时间；
2.双方来往的书信、电子邮件等能证明双方感情不和分居的事实；
3.一方在外居住的房屋租赁合同；
4.双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认；
5.人证，双方都认识的朋友或者亲戚，但是单独的证人证言难为法院采信，所以要辅佐以其他的证据。
三、离婚前的分居要注意哪些问题找法网提醒您，离婚前的分居要注意的问题是：
1.分居的原因是由于夫妻感情不和，而不是因工作、学习等原因导致的两地分居，以及因住房问题造成的夫妻不能同室而居。
2.分床不是分居。对于分居的理解，一般指分床分食分开居住，同居一个住所各在各自房间睡，不过性生活，这种分床，一般不认为是分居。 分居强调的是夫妻双方互不履行夫妻义务，而不是单方面的不履行义务。
3.在我国，并不存在登记分居的制度，因而分居不必登记。
