我公司同时起诉我本人和对方公司

可以同时起诉，不过，你陈述的情况过于简略了，无法判断你在该案中可能面临的风险有哪些。

安合同规定甲方须付清余款24万左右,很简单就是走法律程序。我需要多少费用?那些资料?

按照标的计算费用，你要承担的无非是诉讼费、保全费以及可能发生的律师费等。

医院责任事故的赔偿问题

医疗纠纷赔偿的专业性很强，建议还是委托律师予以协助吧。

交通事故引起的工伤

这个要看你的处置方式了，操作得当的话，两者都能得到。