根据我国《商标法》的规定,商标注册人享有商标专有权,受法律保护。未经商标注册人的许可,在同一种商品或者类似商品上使用与其注册商标相同或相近的商标的,属侵犯商标专用权。因此,若你没有证据证明对方企业有恶意抢注商标,即使你公司并不知道该商标已被注册,但因事实上已构成对该企业的侵权,仍应依法承担侵权的民事责任,包括停止侵权、赔偿损失。