合法的劳动合同应该包括

您好，这是不合法的，公司应支付全部工资。您可以向当地的劳动监察部门进行投诉举报或者申请劳动仲裁 《劳动合同法》第八十五条　用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金： （一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的； （二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的； （三）安排加班不支付加班费的；　 （四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。 第三十条　用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。 用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。

合作协议属于平等民事主体之间的合同关系，不属于劳动合同。但是既然说到工资，那就要看实际履行的究竟是劳动关系还是合作关系。