在保密协议中，乙方必须承担义务，在乙方离开后不支付保密费用，列入工资。保密协议不得在两年内从事同样的工作。

根据《劳动法》第44条、劳动部《工资支付暂行规定》第十三条，用人单位在劳动者完成劳动定额或规定的工作任务后，根据实际需要安排劳动者在法定标准工作时间以外加班加点的，事后应尽量给予同等时间的补休。确实不能补休的，应按以下标准支付加班加点工资：　　
(1)依法安排劳动者在日法定标准工作时间以外延长工作时间(加点)的，按照劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付工资。　　
(2)依法安排劳动者在休息日工作的，按照劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付工资。　　
(3)依法安排劳动者在法定休假节日工作的，按照劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付工资。　　实行计件工资的劳动者，在完成计件定额任务后，由用人单位安排延长工作时间的，应根据上述规定的原则，分别按照不低于其本人法定工作时间计件单价的150%、200%、300%支付其工资。　　经劳动行政部门批准实行综合计算工时工作制的，其综合计算工作时间超过法定标准工作时间的部分，应视为延长工作时间，并应按本规定支付劳动者延长工作时间的工资。　　实行提成工资、包干工资等工资形式的劳动者，由用人单位安排延长工作时间的，均按照实行计件工资制的劳动者加班加点工资的支付办法和标准支付。

1、劳动合同的霸王条款违反法律规定，属于无效约定；
2、劳动合同的内容必须具备以下条款：用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人；劳动者的姓名、住址和居民身份证或者其他有效身份证件号码；劳动合同期限；工作内容和工作地点；工作时间和休息休假；劳动报酬；社会保险；劳动保护、劳动条件和职业危害防护；法律、法规规定应当纳入劳动合同的其他事项；
3、劳动合同中有霸王条款，可以向劳动监察大队投诉，由劳动监察大队责令用人单位整改，给劳动者造成损失的，应当赔偿；

保密协议是作为劳动合同的一个附加条件存在的，公司与你没有签订劳动合同，保密协议也就没有存在的基础，且该保密协议违反了公平原则，故保密协议对你没有约束力。相反，自2008年1月1日起，劳动合同法正式实施后，公司自2月1日起必须与你签订书面的劳动合同，至今没有签订，公司是直接违反了劳动合同法的规定的。
因此建议你直接提起劳动仲裁，要求解除目前的劳动关系，确认保密协议无效，要求公司退还保密费，补交劳动保险，双倍支付自2008年2月1日起至提起劳动仲裁之日止的工资。