9月末退休的10月10日的工资中扣除了公积金和保险

根据我国劳动合同法规定，用人单位须在一个月内与劳动者签订劳动合同。超过一个月没有签订的，要从一个月开始支付直至一年的每个月双倍工资。超过一年未予签订的，视为已经签订无固定期限劳动合同。
你单位这种情况要支付你的每个月双倍工资，你同意可以去你的单位当地的劳动争议仲裁委员会要求仲裁

辞职不会被扣工资，提前三十日书面提交辞职书即可，根据规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。
但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。用人单位以辞职为由扣工资可以到当地劳动监察大队投诉。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

住房公积金的定义　　住房公积金是单位及其在职职工缴存的长期住房储金，是住房分配货币化、社会化和法制化的主要形式。住房公积金制度是国家法律规定的重要的住房社会保障制度，具有强制性、互助性、保障性。单位和职工个人必须依法履行缴存住房公积金的义务。这里的单位包括国家机关、国有企业、城镇集体企业、外商投资企业、城镇私营企业及其他城镇企业、事业单位、民办非企业单位、社会团体。　　职工有下列情形之一的，可以提取职工住房公积金账户内的存储余额：　　
(一)购买、建造、翻建、大修自住住房的;　　
(二)离休、退休的;　　
(三)完全丧失劳动能力，并与单位终止劳动关系的;　　
(四)出境定居的;　　
(五)偿还购房贷款本息的;　　
(六)房租超出家庭工资收入的规定比例的。　　依照前款第
(二)、
(三)、
(四)项规定，提取职工住房公积金的，应当同时注销职工住房公积金账户。职工死亡或者被宣告死亡的，职工的继承人、受遗赠人可以提取职工住房公积金账户内的存储余额;无继承人也无受遗赠人的，职工住房公积金账户内的存储余额纳入住房公积金的增值收益。　　职工提取住房公积金账户内的存储余额的，所在单位应当予以核实，并出具提取证明。　　职工应当持提取证明向住房公积金管理中心申请提取住房公积金。住房公积金管理中心应当自受理申请之日起3日内作出准予提取或者不准提取的决定，并通知申请人;准予提取的，由受委托银行办理支付手续。