我还在高等院校里工作中，可是是公司注册，工作中一年要离职去考博士，现档案资料还要人事处，规定我依照协议书交了巨额的合同违约金才帮我调档案，我想问一下我该怎么做？感谢解释

依据当事人是否有约定违约金，分为约定赔偿和法定赔偿：
约定赔偿包括两种情形：当事人在合同约定赔偿的条款，另一种是合同没有约定，但合同成立后达成赔偿的协议。
1、约定赔偿
指合同当事人在订立合同时，预先约定一方违约产生的赔偿额的计算方法或向对方支付一定的金钱。
由于损失的范围在合同订立时难以确定，因此，当事人在合同中只能约定赔偿的计算办法，而不宜约定一个固定的赔偿数额。
赔偿可以用金钱货币形式确定，也可以用非金钱方式确定。
2、法定赔偿
指在当事人一方违约造成对方损失时，按照法律规定的办法计算赔偿额进行赔偿。这里所说的法律，既包括合同法，也包括有关合同违约赔偿的其他法律法规规定。
法定赔偿方法一般是在当事人没有事先约定赔偿或者违约金的情况下运用。
在法定情况下，法律不仅规定了违约赔偿的条件、范围，也规定了赔偿的计算办法等。
尤其应当注意的是，在当事人没有约定赔偿的情况下，有些法律还规定了赔偿限额，主要是对运输合同中承运人规定了最高赔偿限额。
对超过这一限额的，违约方不承担赔偿责任。