房屋有买卖合同，已经备案，起诉房地产证合法处理吗？

办理登记备案手续时，开发企业应提交《商品房销售许可证》和《商品房买卖合同》（一式五份），其中合同内容填写清楚，各种印鉴清晰，如有补充合同，应装订在统一合同的背面，并加盖骑缝章，在合同最后应付上购房人所购房屋的平面图，并加盖骑缝章。
根据规定，购房者应在办理登记备案手续时，交纳房屋买卖契税，并由契税代缴部门为其开具纳税完税证。
不办理买卖合同备案手续，双方签订的合同不能办理交易、产权登记、抵押登记等各项手续，凡房地产开发经营企业未按本通知办理登记备案手续的，由房地产管理部门责令其补办手续。

房产买卖纠纷诉讼时效应该是为三年的。合同的诉讼时效就是指合同的一方当事人在法定期间不行使自己的权利即丧失了请求法院依诉讼程序强制义务人履行义务的权利。也就是说，合同的权利人在诉讼时效期间不起诉的便失去了胜诉权。
合同作为民事合同的一种，诉讼时效适用于民法总则中一般的时效规定，2017年10月1日施行的中华人民共和国民法总则第一百八十八条对诉讼时效的规定：向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。
法律另有规定的，依照其规定。从权利人知道或者应当知道权利被侵害时起计算。

商品房买卖合同产权登记的办理　　
1、现售商品房的，自本合同签定之日起30日内，甲乙双方应向房屋所在地土地房屋登记机构提出办理本商品房《房地产权证》的申请，提交土地房屋登记机构规定的相关资料，并取得土地房屋登记机构出具的登记受理单。　　
2、预售商品房的，在本商品房实际交付使用之日起60日内，由甲乙双方向房屋所在地土地房屋登记机构提出办理本商品房《房地产权证》的申请，提交土地房屋登记机构规定的相关资料，并取得土地房屋登记机构出具的登记受理单。　　
3、甲、乙双方应相互配合办理本商品房产权登记。由乙方委托甲方办理的，乙方应在签定本合同日内，将办理本商品房产权登记需由乙方提供的资料提供给甲方。　　
4、如因甲方的责任，未能按期向房屋所在地土地房屋登记机构提交办理本商品房《房地产权证》的申请，取得土地房屋登记机构出具的登记受理单的，双方同意按下列方式处理：　　按逾期时间，分别处理(不作累加)：　　
(1)逾期在日(含)之内，自约定向土地房屋登记机构提交资料并取得登记受理单之日起，至甲方实际提交资料并取得土地房屋登记机构出具的登记受理单之日止，甲方按日向乙方支付已付房价款万分之的违约金，并于甲方实际取得土地房屋登记机构出具的登记受理单之日起30日内向乙方支付违约金。　　
(2)逾期超过日(与本条本款第
(1)项约定的日期相同)后，乙方有权解除合同。乙方要求解除合同的，甲方应当自解除合同通知到达之日起30日内退还全部已付房价款及利息(按银行同期贷款利率计算)，并按乙方已付房价款百分之向乙方支付违约金。乙方要求继续履行合同的，合同继续履行，自约定向土地房屋登记机构提交资料并取得登记受理单之日起，至甲方实际提交资料并取得土地房屋登记机构出具的登记受理单之日止，甲方按日向乙方支付已付房价款万分之(该比率应不小于本条本款第
(1)项中的比率)的违约金，并于甲方实际取得土地房屋登记机构出具的登记受理单之日起30日内向乙方支付违约金。