如何保护不能在工商登记系统登记但不能在工商登记系统登记的股东的权益

一、所谓改制，就是打破旧的经济体制下以所有制为核心的企业制度，建立新的符合市场经济规律的以产权为核心的现代企业制度。这一定义准确地指出当时国企改革的工作重点——将全资国有的企业转变为多元投资主体的公司。改制即是国企改革的延伸，是现代化企业制度的完善和深化的过程。

二、转制和改制这些都是十分具有“中国特色”的词，意义基本相同，都是指在国有性质的企业、事业等单位，改变产权结构的一种方式。通俗地讲就是“国有”的性质或“国有成分”比例有所改变了。

三、但改制和转制也是有区别的：“转制”相对具有整体性，多指国有性质的整体转换，如国有企业通过出让等方式变成民营企业，全额拨款的国有事业单位变成自负盈亏的企业等等；“改制”的概念相对大一点，只要国有性质的成分或比例一有改变即可称为“改制”，如国有企业引入外部投资，实施股权多元改造等，“转制”仅是改制的一种特殊情况。

四、在不需要很严谨的表达时，这两者基本通用。

解决股东间纠纷
首先要确定纠纷的源头，是利润分红导致的还是关于未来经营战略分歧导致的。
其次要梳理目前的原始股权结构，了解股权的作用。股权最基本的三项权利就是资产所有权、经营权、分红权。
若无事先其他协议约定，分红权按照原始股权比例进行分红。
利润分成导致的问题纠纷最容易解决，因为存在约定，分钱多分钱少按照事前约定或者特殊情况特殊处理。
如果是经营战略出现分歧，则需要明确在原始股权结构中谁是主导人。
在股权方面，占股67%以上成为绝对大股东，按照公司法，股东会超过2/3投票的所有决定都可以生效。占股51%为相对大股东，一般性的方针战略相对大股东同意便可以实施推进。
但是很多公司开始的时候，几个人股权均分，为了保证每个股东利益，利润分红均分，但是无意中把经营权也分了下去，公司后期发展成熟，如果在经营战略方面发生分歧几个人无法敲定，按照《公司法》规定，按照股权比例投票决定。

工商局只登记股份有限公司的发起人股东，其他股东不予登记。
1、《中华人民共和国公司登记管理条例(2016修订)》第二十一条：申请设立股份有限公司，应当向公司登记机关提交下列文件：发起人的主体资格证明或者自然人身份证明。
2、上市公司以、新三板挂牌公司及区域性股权中心发行股票的股份有限公司亦均只登记发起人姓名，其他出资信息由企业自行公示。