工厂老板欠我两个月的工资，需要工资的时候被上司打住院了，现在出院没钱，该委托哪个部门处理呢

《劳动法》第50条明确规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”　　如果用人单位拖欠劳动者工资，劳动者可以向当地的劳动监察部门（一般设在劳动局内）举报用人单位，劳动监察部门会责令用人单位向劳动者支付工资。
这是通过行政手段来维护劳动者自身的合法权益。　　另外，劳动者因用人单位拖欠工资而与用人单位发生争议，可以通过劳动仲裁予以解决，劳动仲裁是解决劳动纠纷的先行程序，只有经过劳动仲裁，才可以向人民法院提起诉讼。
因此，劳动者只要与用人单位存在者劳动关系，无论是否存在劳动合同，则通过上述途径讨要工资。

员工在患病住院期间是有工资的。
职工非因工患病需要出具相关的医院治疗证明，可向用人单位请病假。
根据《劳动部关于贯彻执行若干问题的意见》第59条规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期间内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80％。
　　职工因工受伤符合工伤医疗待遇的，根据工伤保险条例第三十一条规定：职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
　　停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区 的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过 12个月。工伤职工评定伤残等级后，停发原待遇，按照本章的有 关规定享受伤残待遇。
工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗的，继续享受工伤医疗待遇。

用人单位拖欠工资怎么办

在用人单位拖欠工资的情况下，农民工要先和用人单位协商，如果协商无法解决，则可以通过以下法律途径来解决：

(1)向当地劳动保障监察机构投诉举报;

(2)向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，需要注意的是，要在劳动争议发生之日起60日内向劳动争议仲裁委员会提出书面申请;

(3)通过诉讼途径解决。这又分三种情况：一是针对劳动纠纷案件，经劳动仲裁后任何一方不服的，可以向法院提起诉讼;二是经仲裁后都服从，劳动仲裁裁决生效后，用人单位不执行的，农民工可申请法院强制执行;三是属于劳务欠款类的可直接向法院提起民事诉讼。

需要特别指出的是，在碰到拖欠工资等权益受到侵害的情况时，千万不能采取爬楼、堵路等过激行为和暴力等手段，一定要依靠法律途径来解决问题。否则，一时冲动不但于事无补，还有可能因触犯刑律被追究责任。

用人单位拖欠工资的赔偿金是要分情况计算的。如果单位在规定时间内不支付工资，则要加发工资报酬25%的赔偿金;如果单位在劳动行政部门限期内仍不支付工资，则要按金额50%以上100%以下的标准向劳动者加付赔偿金。