你好员工没有打招呼直接就走了，过了5天来要工资，工作了9天！按照旷工处理，旷工一天扣除3天这样合法吗

第一次旷工，通过口头或书面警告，让本人认识到错误的严重性并且责令反省；
第二次旷工，以全公司通报批评的方式警示本人及其他员工，并由主管领导进行谈话，记大过处分；
第三次旷工，开除或劝退。

员工旷工一般是指未向部门和公司主管领导书面申请并经批准者，或未按规定时间请假，或违反病、事假规定，或违反公司制度中其它有关规定等行为。 　　公司所有的规章制度，都要在合法的前提下制订，但这些规章制度特别象您所列的，涉及到员工利益的规定，必须要经过职代会或职工大会讨论通过，并公告，否则是无效的。
　　依据：《中华人民共和国劳动合同法》第四条规定：用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
　　在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。 　　用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
　　当然，如违法的规章制度，即使这样做了，也是无效的。

1、劳动法对员工旷工是没有处理依据的，如果因旷工造成了用人单位损失的，可以要求赔偿的。
2、《工资支付暂行规定》第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
3、经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。