如果公司辞职，公司有权扣除工资吗？

根据《劳动法》第九十八条、劳动部《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》第三条、《违反〈中华人民共和国劳动法〉行政处罚办法》第六条和第十六条、《违反〈劳动法〉有关劳动合同规定的赔偿办法》第二条和第三条关于
“用人单位违反本法规定的条件解除劳动合同或者故意拖延不订立劳动合同的，由劳动行政部门责令改正;对劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任”。
“用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，除在规定时间内全额支付劳动者工资报酬外，还需加发相当于工资报酬25%的经济补偿金”。
“用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资，侵害劳动者合法权益的，应责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可责令按相当于支付劳动者工资报酬、经济补偿总合的1至5倍支付劳动者赔偿金”。
“用人单位未按《劳动法》规定的条件解除劳动合同或者故意拖延不订立劳动合同，即招用后故意不按规定订立劳动合同，对劳动者造成损害的，应赔偿劳动者损失”
“造成劳动者工资收入损失的，按劳动者本人应得工资收入支付给劳动者，并加付应得工资收入25%的赔偿费用”等，根据上述有关规定，用人单位即使未与劳动者签定合同，也不能任意扣发劳动者工资。

一般说来，用人单位拖欠就业者工资有两种情况：⑴．用人单位遇到了人力不能抗拒的灾害等原因，或者确实生产经营困难、资金周转困难，不能按时发放工资。在这种情况下，用人单位应该向就业者说明情况，征得就业者们的同意，延期支付工资。延期时间的最长限制由各省、市、自治区的劳动行政部门确定。就业者应理解用人单位的困难，正常工作。⑵．用人单位故意拖欠工资。故意拖欠工资就是用人单位无正当理由，超过规定的发工资的时间后而没有发放工资。这种情况目前也不少，就业者应该与用人单位交涉，敦促及早发放工资。如果不能解决，可以向劳动行政部门申请争议仲裁。克扣工资是指用人单位无正当理由而扣减就业者的应得工资。
克扣工资不包括以下情况：
（1）国家法律、行政法规中有明确规定的；
（2）依法签订的劳动合同中明确规定的；
（3）已制订并且经过职工代表大会批准的用人单位内部规章制度中规定的；
（4）用人单位工资总额与经济效益相联系，经济效益下浮时就业者工资必须下浮的；
（5）就业者请事假减发的工资等。
用人单位克扣或无故拖欠工资的，按照《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》的规定，除了支付就业者工资报酬外，还应加发相当于工资报酬25%的经济补偿金。

辞职后公司最后一个月工资中社会保险　会代扣到你社会在本企业的中止日期，如果没有中止交费则须代扣个人应缴纳的部分。
　　用人单位代扣代缴社保是公司提法定义务与责任，用人建立了社保关系则要按规定交缴纳个人应缴部分，否则会造成断交费问题，与劳动者是不利的。
　　同时，社保缴费都是公司缴费（大部分）＋个人缴费（小部分）来构成，从情理法理上最后一个月工资都应扣个人应缴费部分。在解除劳动合同关系时公司应出具解除合同证明给你，写明你的社保缴纳基本情况，截至月份等。