如果企业通过罚款迫使员工离职，它能申请仲裁吗？

具体情况具体分析，例如，申请劳动仲裁的时效：
《劳动仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。
从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提

不让加班合法，自动离职要赔偿用人单位损失。

根据《劳动法》第四十一条、第四十四条规定，加班由用人单位根据生产经营工作需要，经与工会和劳动者协商之后安排，并且每天不得超过3小时，每月不得超过36小时。
法律保护劳动者休息权，从多方面限制加班，用人单位不安排劳动者加班符合法律规定。

自动离职，指劳动者根据用人单位和自身情况擅自离职，而强行解除与用人单位的劳动关系的一种行为，属于违法解除合同，劳动者因为用人单位不安排加班自动离职，是因为自身愿意自动离职，不存在用人单位逼迫的问题。
根据《劳动合同法》第九十条规定，应当赔偿用人单位损失。

劳动者解除合同应当遵循法定条件和程序，在用人单位没有《劳动合同法》第三十八条规定的法定过错的情形下，可以协商一致或者提前30天书面通知解除合同。
不可以自动离职。

《劳动法》

第四十一条用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过1小时;因特殊原因需要延长工作时间的在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。

《劳动合同法》
第九十条劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。

劳动部
《关于实行劳动合同制度若干问题的通知》
劳部发〔1996〕354号
18．职工解除劳动合同，应当严格按照《劳动法》的规定，提前三十日以书面形式向用人单位提出。
职工自动离职属于违法解除劳动合同，应当按照《违反〈劳动法〉有关劳动合同规定的赔偿办法》承担赔偿责任。

员工离职是劳动合同解除。
　　劳动合同到期，劳动者提出不续签属于劳动合同终止。
　　
一、个人提出离职分三种情况：
　　
1、用人单位存在《劳动合同法》38条的情况，劳动者书面提出解除劳动关系后可以立即走人不需要用人单位的批准，并可以要求支付剩余的工资及经济补偿金（每工作1年支付1个月工资）及办理离职手续等；
　　
2、依据《劳动合同法》37条，你提前30天提出的书面离职，不需要用人单位批准就可以离职。其中，试用期提前3天书面提出；用人单位有义务结清工资办理离职手续。
　　
3、没有提前30天提出离职，用人单位也不存在《劳动合同法》38条的情况，你直接提交辞职信就走人，这个时候就是你违法了，给用人单位造成的直接经济损失、招聘你产生的费用，用人单位可以要求你承担。