如果员工因身体原因自愿辞职，公司应该根据劳动法做什么？

用人单位不缴纳社会保险费，劳动者辞职，可以要求用人单位支付经济补偿。
根据《劳动合同法》第三十八条第三项规定：用人单位未依法为劳动者缴纳社会保险费的，劳动者可以解除劳动合同。
按照第四十六条第一项规定，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
至于劳动者以什么理由辞职不是问题所在，用人单位违法是问题的主要方面。劳动者的认识可以有一个过程，只要以用人单位不依法缴纳社会保险费为由，主张经济补偿是合理的，就应当支持。

1、单位未签署劳动合同，应支付你未签书面劳动合同双倍工资差额;如已具备签订无固定期限劳动合同条件，还可要求单位支付未签无固定期限劳动合同双倍工资的赔偿金;
2、法律依据：
（1）《中华人民共和国劳动合同法》第82条：“用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。用人单位违反本法规定不与劳动者订立无固定期限劳动合同的，自应当订立无固定期限劳动合同之日起向劳动者每月支付二倍的工资。”
（2）《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第条：“用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当依照劳动合同法第八十二条的规定向劳动者每月支付两倍的工资，并与劳动者补订书面劳动合同；劳动者不与用人单位订立书面劳动合同的，用人单位应当书面通知劳动者终止劳动关系，并依照劳动合同法第四十七条的规定支付经济补偿。”前款规定的用人单位向劳动者每月支付两倍工资的起算时间为用工之日起满一个月的次日，截止时间为补订书面劳动合同的前一日。

1、劳动者主动解除劳动合同（辞职）的，用人单位无需支付经济补偿金。
2、若用人单位存在《劳动合同法》第三十八条(如未依法缴纳社会保险，未及时足额发放工资等）之情形，劳动者可以解除劳动关系，并要求用人单位支付经济补偿金。