你好，单位克扣加班工资，可以劳动仲裁吗？

1、去当地人力资源和社会保障局（原劳动局）内的劳动争议仲裁委，申请劳动仲裁。需提交的材料：仲裁申请书2份、申请人身份证复印件1份；相关证据复印件和证据清单2份；部分地区还需要提供用人单位的工商登记信息；
　　
2、提交材料后，5个工作日仲裁委给予立案。劳动仲裁委不收费。然后给双方举证期；之后开庭审理，并且对你们双方进行调解，调解不成仲裁委会下达裁决书；劳动仲裁60天内结案；对于裁决书不服，我们可以起诉到法院；
　　
3、可以不请律师代理，自己亲自处理，收齐相关法律文书，一样能胜诉；
　　
4、申请劳动仲裁期间，不耽误你去新单位工作。

所谓克扣工资系指用人单位无正当理由扣减劳动者应得工资(即在劳动者已提供正常劳动的前提下，用人单位按劳动合同规定的标准应当支付给劳动者的全部劳动报酬)。　　依据原劳动部《对〈工资支付暂行规定〉有关问题的补充规定》，克扣劳动者的工资不包括以下减发工资的情况：　　
(1)国家法律、法规中有明确规定的；　　
(2)依法签订的劳动合同中有明确规定的；　　
(3)用人单位依法制定并经职代会批准的厂规厂纪中有明确规定的；　　
(4)企业工资总额与经济效益相联系，经济效益下浮时，工资必须下浮的(但支付给劳动者工资不得低于当地最低工资标准)；　　
(5)因劳动者请事假等相应减发工资等。　　克扣工资的法律责任　　根据《劳动合同法》第85条的规定，用人单位未依照劳动合同的约定或未依照本法规定支付劳动者劳动报酬的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额50%以上100%以下的标准向劳动者加付赔偿金。　　在用人单位拖欠或未足额发放劳动者报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。

进行劳动仲裁和拿回工资之间没有必然的关联性，申请了劳动仲裁，并不表示就一定可以拿回工资的。劳动争议仲裁只是解决劳动纠纷的一种方式，如果用人单位拖欠工资的，职工可以向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
一般来说，通过申请劳动仲裁拿回工资的可能性较大，但是拿回的工资会打折扣。