我入职两年，单位未签劳动合同，劳动仲裁决我主张双倍工资赔偿，超过劳动仲裁时效。申请仲裁时劳动关系未解除。裁决合法吗？

劳动合同存续期间，劳动者要求解除劳动关系的，应当提前30日以书面形式提交申请。由此给用人单位造成的损失，应当由劳动者赔偿。只要劳动者履行提前通知的义务，原则上无需用人单位同意。
若用人单位迟迟不办理离职手续，劳动者可以通过劳动仲裁要求解除劳动关系。

可以得到赔偿。根据劳动合同法，连续签订两次以上固定期限后，自动转为无固定期限合同。那么，按照你的说法，可定连续签订2次以上了，那现在跟公司就是无固定期限合同关系。这样，公司无故解除合同，就应该支付经济补偿金。
每一年按照一个月的工资赔偿。至于98年到05年期间，因为在劳动合同法颁布之前，不能适用新劳动法，需要看当时的规定，另外也需要有证据证明你的说法。

解除劳动合同如何赔偿，　　劳动者可以依法领取经济赔偿金的情形包括：　　
1、协商解除劳动合同。就是用人单位和劳动者协商一致解除劳动合同。这时，用人单位应当根据该职工在单位工作的年限，每满一年发给相当于1个月工资的经济补偿，但是最多不超过12个月。　　
2、因病或非因工负伤解除劳动合同。就是劳动者生病或者非因工负伤，经劳动鉴定委员会确认不能从事原工作，也不能从事用人单位安排的其他工作，用人单位与其解除劳动合同。这时，用人单位应当根据该职工在单位工作的年限，每满一年发给相当于1个月工资的经济补偿金，同时还应当发放不低于6个月的医疗补助费。患重病和绝症的还应赠加医疗补助费，或重病的增加部分不低于医疗补助费的50%，换绝症的增加部分不低于医疗补助费的100%。　　
3、劳动者不能胜任工作解除劳动合同。就是劳动者经过培训或者调整岗位仍不能胜任工作，用人单位解除劳动合同。这时，用人单位应当根据该职工在单位工作的年限，每满一年发给相当于1个月工资的经济补偿，但是最多不超过12个月。　　
4、因发生重大变化解除劳动合同。就是签订劳动合同时的客观情况发生重大变化，致使原劳动合同无法履行，用人单位和劳动者又不能就变更劳动合同达成一致意见，用人单位解除劳动合同。这时，用人单位应当根据该职工在单位工作的年限，每满一年发给相当于1个月工资的经济补偿。　　
5、因经济性裁员解除劳动合同。就是有人单位濒临破产或在法定整顿期间，或者生产经营状况发生严重困难，必须裁减人员解除劳动合同。这时，用人单位应当根据该职工在单位工作的年限，每满一年发给相当于1个月工资的经济补偿，但是最多不超过12个月。　　相关知识延伸阅读：劳动合同的规定　　根据《中华人民共和国劳动法》(以下简称《劳动法》)第十六条第一款规定，劳动合同是劳动者与用工单位之间确立劳动关系，明确双方权利和义务的协议。劳动合同明确双方在劳动关系中的地位作用，劳动合同是一种双务有偿合同，劳动者承担和完成用人单位分配的劳动任务，用人单位付给劳动者一定的报酬，并负责劳动者的保险金额。　　2013年7月1日，我国新修订的《中华人民共和国劳动合同法》将正式实施。新政最大的亮点是，明确规定了被派遣劳动者，也就是通常所说的“临时工”，享有与用工单位“正式工”同工同酬的权利，并赋予人社部门依法开展经营劳务派遣业务行政许可的权利。　　根据劳动合同，劳动者加入企业、个体经济组织、事业组织、国家机关、社会团体等用人单位，成为该单位的一员，承担一定的工种、岗位或职务工作，并遵守所在单位的内部劳动规则和其他规章制度;用人单位应及时安排被录用的劳动者工作，按照劳动者提供劳动的数量和质量支付劳动报酬，并且根据劳动法律、法规规定和劳动合同的约定提供必要的劳动条件，保证劳动者享有劳动保护及社会保险、福利等权利和待遇。