你好，我们公司把底薪和加班费分两次发，但按总工资扣除了我们的个人所得税，这算违法吗

在计算应纳税所得额时，下列支出不得扣除：　　
1、资本性支出。是指纳税人购置、建造固定资产，以及对外投资的支出。企业的资本性支出，不得直接在税前扣除，应以提取折旧的方式逐步摊销。　　
2、无形资产受让、开发支出。是指纳税人购置无形资产以及自行开发无形资产的各项费用支出。无形资产受让、开发支出也不得直接扣除，应在其受益期内分期摊销。　　
3、资产减值准备。固定资产、无形资产计提的减值准备，不允许在税前扣除;其他资产计提的减值准备，在转化为实质性损失之前，不允许在税前扣除。　　
4、违法经营的罚款和被没收财物的损失。纳税人违反国家法律。法规和规章，被有关部门处以的罚款以及被没收财物的损失，不得扣除。　　
5、各项税收的滞纳金、罚金和罚款。纳税人违反国家税收法规，被税务部门处以的滞纳金和罚款、司法部门处以的罚金，以及上述以外的各项罚款，不得在税前扣除。　　
6、自然灾害或者意外事故损失有赔偿的部分。纳税人遭受自然灾害或者意外事故，保险公司给予赔偿的部分，不得在税前扣除。　　
7、超过国家允许扣除的公益、救济性捐赠，以及非公益、救济性捐赠。纳税人用于非公益、救济性捐赠，以及超过年度利润总额12%的部分的捐赠，不允许扣除。　　
8、各种赞助支出。　　
9、与取得收入无关的其他各项支出。

在职员工不称职（不胜任工作），用人单位有合理调岗的权力、经双方协商薪酬标准（书面形式）确定，执行调岗后新工资标准。
　企业调岗的目的之一就是合理的调整薪酬，否则对许多企业而言，调整岗位就失去了意义。对于劳动者不胜任工作的情形，法律规定了用人单位有合理调岗的权利，经双方协商薪酬标准（书面形式）确定，执行调岗后新工资标准。
　　岗位管理包含了岗位的薪酬管理，岗位异动也往往伴随着岗位报酬标准的变动，法律规定了企业在员工不胜任前提下可调岗，其让渡的应当是完整的岗位管理权，该权利包括履行新的岗位薪酬标准、新的考核办法等。员工因不胜任工作而被调整到新的岗位，其薪酬应当根据新岗位的标准确定，否则有违于“同工同酬”的基本立法思想。但另一方面，为了防止企业调薪权利的滥用，企业在调薪操作时应当基于以下前提：
　　
1、有明确的岗位职系和薪酬对应标准；若无制度规定和合同约定，调岗后的薪酬标准应当协商确定，而不能由用人单位单方确定。
　　
2、与员工书面确定新的岗位与报酬标准。

个人所得税=应纳税所得额X税率-速扣数。工资、薪金计算公式：缴税=全月应纳税所得额*税率-速算扣除数 全月应纳税所得额=(应发工资-四金)-个税起征点 实发工资=应发工资-四金-缴税 个税起征点：现行起征点按3500元/月的起征标准算。