我和孩子他爸没有登记办结婚证，现在双方协议解除同居关系，孩子有女方抚养，现在需要公证孩子的抚养权，怎么公证呢

这种情况并不属于法律上的婚姻关系，不受法律保护。因此也不会构成重婚罪。
1、1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以前，男女双方已经符合结婚实质要件的，按事实婚姻处理；
2、1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以后，男女双方符合结婚实质要件的，人民法院应当告知其在案件受理前补办结婚登记；未补办结婚登记的，按解除同居关系处理。

根据《婚姻法》的规定，父母均有抚养子女的权利和义务。父母离婚后，子女归一方抚养，如一方或双方的情况或抚养能力发生较大变化，可提出变更子女抚养权的要求。变更子女抚养权一般先由双方协商确定，如协商不成，可通过诉讼请求人民法院裁决变更。
因此，离婚后的父母双方经协商一致对子女的抚养权进行变更的，需要签订一份《变更抚养权协议》。由于先前双方签订的《离婚协议书》已在婚姻登记部门备案，《变更抚养权协议》是对《离婚协议书》内容的重大修改，另外，变更抚养权属于重大人身关系变更，有关部门出于谨慎，故要求该对离婚男女之间签订的《变更抚养权协议》办理公证。

《公证法》第三十六条规定“经公证的民事法律行为、有法律意义的事实和文书，应当作为认定事实的根据，但有相反证据足以推翻该项公证的除外”。正由于公证具有法定的证据效力，人民法院及政府部门、相关企事业单位都乐于采纳公证书。

由于《变更抚养权协议》双方当事人对被抚养的孩子有特定的人身利益，公证处的公证人员根据《公证程序规则》的规定，要求双方应亲自到公证处申请办理公证手续，不得委托他人办理。

首先，既然双方属于同居关系，婚姻法不支持也不鼓励，不在法律调解的范围内。这是他们对自己生活状况的选择，同居关系存在、解除与否法律不予干涉，其起诉解除同居关系人民法院不予受理。但是，由于双方涉及财产分割问题，法院可以受理。根据《中华人民共和国婚姻法》若干问题的解释
（二）为此作出了明确规定：当事人请求解除同居关系的，人民法院不予受理。但当事人请求解除同居关系，属于婚姻法第三条、第三十二条、第四十六条的“有配偶者与他人同居”的，人民法院应当受理。当事人因同居关系期间财产分割或者子女抚养提起诉讼的，人民法院应当受理。　　其次，关于孩子抚养权的问题，法院会本着对孩子有利的原则进行审判，法院会从抚养能力，生活环境，学习环境等进行综合分析。以下是法院关于孩子抚养权的判决已经。　　　第一，两周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活：　　
（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；　　
（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；　　
（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。　　
（4）父母双方协议两周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。　　第二，对两周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑：　　
（1）已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的；　　
（2）无其他子女，而另一方有其他子女的；　　
（3）父方与母方抚养子女的条件基本相同，双方均要求子女与其共同生活，但子女单独随祖父母或外祖父母共同生活多年，且祖父母或外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或外孙子女的，可作为子女随父或母生活的优先条件予以考虑。　　第三，对于十周岁以上的未成年子女随父或随母生活发生争执的，应考虑该子女的意见。　　第四，在有利于保护子女利益的前提下，父母双方协议轮流抚养子女的，可予准许。