您好！我自建的湖北天门市3层楼，由于本人一直在深圳发展，当时1999年只办理了集体土地使用证，现在如何办理房产证

集体办的房产证，属于小产权房，小产权房不可以转到个人名下的。
小产权房买卖：
一、所谓“小产权”是指在农民集体土地上建设的房屋，未缴纳土地出让金等费用，其产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡政府或村政府颁发，所以叫做“乡产权”，又叫“小产权”。
二、乡镇政府发证的所谓小产权房产，实际上没有真正的产权。这种房没有国家发的土地使用证和预售许可证，购房合同国土房管局也不会给予备案。所谓产权证也不是真正合法有效的产权证。
三、国家明令禁止小产权房不能买卖的，但是对于拥有小产权房集体土地的本村户口的居民来讲是可以相互转让的，对于外村的户口居民来讲是不能买卖的。

土地使用证证书是确认土地使用权的法律凭证。土地使用证内各项数据和编号，如单位名称、四至、土地数量、位置、土地变更等，必须与土地登记表相一致。土地使用证附图可根据土地利用现状底图或地籍图透绘获得。随着面积和界线的变更，附图也应作相应改动。　　
一、哪些房子需要办理土地使用证　　城镇住房用地登记发证的范围包括城镇房改房、经济适用住房、商品房和其他住房用地，它是房屋所有权和国有土地使用权发生转移后的变更土地登记，发证对象为拥有房屋所有权的住房产权人。房屋和土地是不可分割的整体，只有进行发证登记并且两者权利主体一致，房屋产权人的合法权益才能得到有效保护。　　
二、如何办理住房土地使用证　　房改房和经济适用房用地，土地使用证的办理：由住房户和原使用土地单位到辖区国土资源管理部门共同申请，国土资源管理部门将依法办理;如原用地单位已不存在，住房户可和该单位的上级主管部门，或现在实际使用原单位土地的单位，到国土资源管理部门共同申请;如果住房由居委会管理，住户可和居委会到国土资源管理部门共同申请。　　商品房住房土地t，土地使用证;的办理：由住房户和开发商共同到所在辖区的国土资源管理部门办理。住房户需要提交的资料包括：房主身份证复印件、售房合同或单位售房证明或房产证。　　如果城镇居民的工作单位或房屋开发商没有给房屋产权人办理住房，土地使用证，房屋产权人可向工作单位或开发商提出要求。仍不办理的，可向所在辖区的国土资源管理部门举报。

集体土地建房不能办理房产证只能办理《集体土地使用证》。
根据土地管理法相关规定，农民集体所有的土地使用权不得出让、转让或出租用于非农业建设。而农村宅基地属集体所有，村民对宅基地也只享有使用权，农民将房屋卖给城市居民的买卖行为不受法律的认可与保护，也就不能办理土地使用证、房产证、契税证等合法手续。