如果双方都同意离婚了，我有两个小孩，法院会把小孩判给女方吗

具体情况具体分析，如果是女方想要离婚的，可以协议离婚或者起诉离婚。一般先协议离婚，协议不成的，可以起诉离婚，起诉离婚的流程为：
1、提交起诉状和相关证据：
（1）起草民事起诉状；
（2）准备诉讼所需要的证据；
（3）向有管辖权的法院递交起诉状、身份证、结婚证和部分证据。
2、法院决定是否受理该诉讼：
（1）立案：人民法院在收到离婚诉讼后，经审查，符合立案条件的，应当在7日内立案，并在立案后的5日内将诉讼状副本送达给被告；
（2）被告提交答辩状：被告在收到诉讼状副本的15日内应提出答辩状；
（3）庭审前准备：审判人员审阅诉讼材料，进行调查研究，收集证据；
（4）通知当事人：人民法院应当更换不符合起诉或应诉条件的当事人，通知符合条件的当事人参加诉讼；
（5）保全：根据当事人诉讼请求依法进行诉讼保全或先行给付。
3、法院对当事人进行调解：
人民法院受理离婚案后，首先应对当事人进行调解。调解产生两个结果:
（1）经调解和好
（2）经调解协议离婚
4、调解不成法庭审理：
（1）安排开庭时间
（2）通知到庭诉讼
（3）开庭审理
5、根据庭审情况判决：
离婚案件的一审程序结束。
如果当事人对判决不服，可向上一级法院提起上诉，进行二审诉讼程序。