如果在工厂上班旷工二天，算自动离职，会支付我工作时间的薪水吗

自动离职、擅自离职的含义是相同的，都是指劳动者不向用人单位打招呼，随意脱离所在工作岗位和所在单位的行为。这种不辞而别的行为是不符合法律规定的，常常会给用人单位造成经济损失，用人单位也往往要追究该劳动者的责任。
用人单位对擅自离职的职工可按旷工处理，给予除名。按照国家规定，自动离职的劳动者不享受任何待遇。

1、只要付出了劳动，就可以拿到劳动报酬；
　　
2、但如果因为旷工给单位造成损失，单位有权要求赔偿；
　　
3、依据：《工资支付暂行规定》第十六条 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付

一、关于旷工三天算自动离职什么是自动离职？原劳动部办公厅《关于自动离职与旷工除名如何界定的复函》（劳办发[1994]48号）曾经明确，“自动离职”是指职工擅自离职的行为。即职工根据企业和自身情况擅自离职，而强行解除与企业的劳动关系的一种行为。如辞职未准擅自离职；未说明原因不辞而别；受优厚待遇诱惑而擅自“跳槽”等。什么是旷工？原劳动部曾经规定，旷工是指费不可抗力因素，职工既不请假，或者请假未被批准，而不出勤。职工不请假3天未上班，应属于旷工。但旷工并非自动离职。用人单位规定旷工3天算自动离职与法律法规精神相悖，属于无效规定。但是，用人单位可以通过民主程序，依法制定规章制度，规定旷工3天，属于“严重违反用人单位规章制度”，经催告不复工可以解除劳动合同。
二、关于工资工资是用人单位依照法律法规规定和劳动合同约定，以各种形式支付给劳动者的工资报酬。根据劳动部《工资支付暂行规定》第九条规定，即使用人单位规定旷工3天，属于“严重违反用人单位规章制度”，经催告不复工解除劳动合同的，也应当按出勤一次性结清劳动者工资。但劳动者因为旷工造成用人单位直接经济损失的，应当赔偿损失。结清工资与赔偿损失是不同共同法律关系，二者应当分别计算，合并结算。劳动部办公厅《关于自动离职与旷工除名如何界定的复函》劳办发[1994]48号
一、《中华人民共和国企业劳动争议处理条例》第二条第
（一）项中的“自动离职”是指职工擅自离职的行为。《劳动合同法》第四条用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。第三十九条劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。劳动部《工资支付暂行规定》第九条劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。