请问一下，动迁协议上有两套房子，是否在房产交易中心办理房产证的时候，可以分开办理呢？上海地区的，而且，两套房子的所有者不是同一个人，不知道是否可以分开办理呢？

目前，离婚案件中涉及到房屋拆迁问题的越来越多，已成为分割夫妻财产的难点问题。
一、要确定被拆迁房屋的性质，即被拆迁房屋是夫妻一方的婚前个人财产还是婚后共同财产？通常有以下几种情况：
1、被拆迁房屋是夫妻一方婚前财产，安置房是按使用人口标准安置的，夫妻另一方有一定的产权份额。
2、被拆迁房屋是夫妻一方的婚前财产，夫妻双方婚后对房屋进行了扩建或者添附，夫妻另一方也有一定的产权份额。
3、被拆迁房屋是夫妻一方父母的财产，安置房是按使用人口标准安置的，夫妻双方均有一定的产权份额。
4、被拆迁房屋是夫妻一方父母的财产，夫妻双方在与父母共同生活期间对房屋进行了扩建或者添附，夫妻双方均有一定的产权份额。另外还有其他一些特殊情况。
前两种情况下，夫妻双方占安置房所有权的分额有较大悬殊，在具体分配房屋时，应着重考虑所有权分额较多的一方，给予对方相应的补偿；
后两种情况下，安置房所有权的主要分额是夫妻一方父母的，夫妻双方所占分额相对较少，应结合实际情况予以处理。

新房房产证的办理收费情况:　　
1、契税:购买一套房，若面积低于90平米，契税按房款的1%征收，超过90平米按房款的
1.5%征收，购买二套房契税按房款3%征收。　　
2、住宅登记费每套80元，非住宅登记费每套550元;公共资金是用于小区管理、小区物业建设的费用，框架结构按照每平米
16.8元缴纳，砖混结构按照每平米
15.6元缴纳。　　
3、居民住宅每套80元，如有共有权证增收工本费10元/本;其它房产建筑面积500(含500)㎡以下的每宗200元，500～1000㎡的为300元，1000～2000㎡的为500元，2000～5000㎡的为800元，5000㎡以上的为1000元;如共有权证增收工本费10元/本。　　二手房房产证办理收费情况：　　
1、办理二手房房产证买卖双方需缴纳的费用有交易费、登记费，买方还需缴纳契税，卖方需缴纳营业税及附加和个人所得税。　　
2、交易费每平米6元钱，登记费每套80元;购买一套房，若面积低于90平米，契税按房款的1%征收，超过90平米按房款的1。5%征收，购买二套房契税按房款3%征收;营业税及附加和个人所得税视房屋面积和房产证办出时间是否超过5年而定。

关于房屋产权，以家庭共有房屋产权为例，家庭是社会的基本细胞，房屋是家庭活动的必要场所。家庭共有房屋是家庭成员集体劳动兴建或通过接受赠与等方式获得的。除依法律规定和当事人另有约定外，家庭共有房屋在分家之前不得分割。