我城郊有一房屋1991年取得《集体土地使用权证》，2003年办理了《房屋所有权证》（房屋底层为商用），2006年该房屋被当地政府征用为国有建设用地后，撤销了原村委建制，建立了城镇居民小组，原农业人口实行了农转非。由于政府财力等诸多原因，我们村房屋一直没进行补偿和拆迁。依照《土地所有权和使用权的若干规定》第十四条（因国家建设征用土地，农民集体建制被撤销或其人口全部转为非农业人口，其未经征用的土地，归国家所有。继续使用原有土地的原农民集体及其成员享有国有土地使用权）和《中华人民共和国土地管理法实施条例》第二条（农村集体经济组织全部成员转为城镇居民其所属土地属于全民所有即国家所有）等规定，我是否可以申请将原有的《集体建设用地使用权证》变更为《国有土地使用权证》？

国有土地使用权，指依法使用国家所有土地的权利。国有土地使用权的主体非常广泛，任何单位和个人，包括境外的企事业单位和个人，符合依法使用中国国有土地条件的，都可以成为中国的国有土地使用者。
国家作为国有土地所有者并不直接使用土地，而是由具体单位和个人来使用。

根据《国有土地上房屋征收评估办法》建房〔2011〕77号规定：“第十四条被征收房屋价值评估应当考虑被征收房屋的区位、用途、建筑结构、新旧程度、建筑面积以及占地面积、土地使用权等影响被征收房屋价值的因素。”首先，房屋价值会受到影响。
另外每个地方的政策和法规是不一样的，有些地方会按土地使用证上的面积对土地部分适当补偿，看地方性文件吧。而且南方个别村镇还实行土地面积拆一还一，房屋及附属按成本补偿。
建议咨询当地机构

土地包括农用地、建设用地、未利用地的使用权即占有、利用、收益土地的权利。土地使用权的客体包括国有土地和集体土地。农用地使用权指的是土地承包经营权；国有土地建设用地指建设用地使用权；集体土地用于建住宅，称宅基地使用权。
土地使用权争议是因土地使用权属归哪一方即权属不清而发生的争议。无论土地性质和用途如何，只要因占有、利用、收益土地的权属归属存在争议，就是土地使用权争议，应由人民政府处理。
土地承包经营权侵权纠纷是权利人已经依法取得的农用地占有、利用、收益权利遭受他人非法的侵犯而发生的纠纷。认定土地承包经营权侵权纠纷的前提是：对占有、利用、收益土地的权属归属不存在争议即权属归属明确。
即使权利人的土地承包经营权曾经被有关机关通过登记发证等程序确认，但利害关系人对权属归属提出异议，这类纠纷仍应认定为土地使用权纠纷，由政府处理。归属经处理、复议、诉讼等程序确认。
土地使用权确认是指在土地使用权的归属不明或发生争议时，利害关系人请求有关权利机关 确认土地使用权归属，从而解决土地使用权争议的行为。土地使用权确认请求权由对特定的土地有利害关系人行使，利害关系人不一定是土地使用权人，在土地使用权的归属不清或发生争议时，利害关系人可以是任何与特定的土地就土地使用权归属有土地使用权法律关系的自然人、法人和其他组织，他们都可以向有关机关或机构提出土地使用权确认的请求。