小作坊食品生产许可证需要在食品药物监督管理局办理。
一、小作坊食品生产许可证办理流程：
首先要注册公司，办理个体工商户营业执照，准备必要的设备和仪器。然后向质监局提交申请，受理申请后，质监局会派人到现场评审，对食品进行抽样检测，经评审合格样品检测，质监局派发食品生产许可证。
二、小作坊食品生产许可证需要具备以下条件：
（一）办理工商注册登记；
（二）与所经营的食品种类和数量相适应的生产场所、生产设备和其他设施；
（三）具备食品安全管理人员和制定有效的食品安全的制度；
（四）设备布局和工艺流程符合国家相关标准的规定。
三、需要提供的材料：
（一）食品生产加工小作坊登记申请表；
（二）三证合一营业执照；
（三）负责人身份证原件复印件
（四）所有员工有效期内健康证；
（五）生产工艺流程图和设备布局图；
（六）主要生产设备和设施清单；
（七）食品安全的规章制度。
