扰乱国家机关工作秩序涉嫌聚众扰乱社会秩序罪和聚众冲击国家机关罪，立案标准为：
1、聚众扰乱社会秩序，情节严重，致使工作、生产、营业和教学、科研、医疗无法进行，造成严重损失的；
2、聚众冲击国家机关，致使国家机关工作无法进行，造成严重损失的；
3、多次知扰乱国家机关工作秩序，经行政处罚后仍不改正，造成严重道后果的；
4、多次组织、资助他人非法聚集，扰乱社会秩序，情节严重的。
根据《中华人民共和国刑法》第二百九十条规定，聚众扰乱社会秩序，情节严重，致使工作、生产、营业和教学、科研、医疗无法进行，造成严重损失的，对首要分子，处三年以上七年以下有期徒刑；对其他积极参加的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。
聚众冲击国家机关，致使国家机关工作无法进行，造成严重损失的，对首要分子，处五年以上十年以下有期徒刑；对其他积极参加的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。
多次扰乱国家机关工作秩序，经行政处罚后仍不改正，造成严重后果的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。多次组织、资助他人非法聚集，扰乱社会秩序，情节严重的，依照前款的规定处罚。
