按照规定，公司的合同违约金可以税前扣除。 根据国税发〔2000〕84号文件的规定，纳税人按照经济合同规定支付的违约金（包括银行罚息）、罚款和诉讼费可以扣除。但是，因违反法律、行政法规而支付的罚款、罚金、滞纳金不得在税前进行扣除，比如对纳税人支付的税款滞纳金就不能扣除。 1、未发生增值税、营业税应税行为情况下的合同违约金可扣除 增值税暂行条例规定，在中华人民共和国境内销售货物或提供加工、修理修配劳务及进口货物的单位和个人，为增值税的纳税人，应依照条例规定缴纳增值税。 2、已发生增值税、营业税应税行为情况下的合同违约金可扣除 对于增值税、营业税应税行为已经发生，只是合同缔约方未能完全履行合同条款而产生的违约金，应当视一下情况进行涉税处理。
《企业所得税税前扣除办法》第五十六条 纳税人按照经济合同规定支付的违约金（包括银行罚息）、罚款和诉讼费可以扣除。
