首先,需要查看施工合同中是否有关于材料丢失责任及费用承担的明确约定。如果合同中明确规定了材料丢失的责任方及费用承担方式,那么应严格按照合同条款执行。例如,如果合同中规定施工班组需对施工现场的材料安全负责,并承担因管理不善导致的材料丢失费用,那么从施工班组的费用中扣除是合理的。
从法律角度来看,根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规,标的物(包括建筑材料)毁损、灭失的风险,在标的物交付之前由出卖人承担,交付之后由买受人承担。因此,如果材料已经交付给施工单位并由施工班组负责管理,那么施工班组应承担相应的管理责任,并对因管理不善导致的材料丢失负责。然而,这并不意味着施工单位可以随意从施工班组的费用中扣除材料丢失的费用,而是需要依据合同条款或双方协商的结果来确定。