是否赔偿，要看员工是否存在过错，一般情况下，丢失了商品由商店承担损失，除非商店老板有证据证明员工存在过错或者明显过失，那么可以要求员工赔偿，从员工的工
资中扣除，但是不能扣除员工的全部工资，一般每月扣除的工资不能超过月工资的20%，扣除后也不能低于当地最低工资。
法律分析
一般情况下，如果是店内东西被偷盗，而老板又没有证据证明是因为员工的问题而导致商品丢失的话，就不能要求员工赔，应由盗窃人负责赔偿，店员不是盗窃人，没有赔偿义务。
法律也没有规定店员在此种情况下的先行赔付义务，因此，老板也不能要求店员先行赔付，再由店员向盗窃者追偿。如果老板强迫员工赔偿，不仅没有法律依据：，也没有事实依据，在不能查清是否是因为个别员工失职而丢失商品的情况下，由员工承担损失，这种行为已经侵犯了劳动者的财产权，是不合法的。员工遇到类似情况时，可以向劳动行政部门投诉，或者通过司法途径维护权益，可以拨打执法大队电话进行投诉。如果员工负有保管义务，但是因为玩忽职守导致商品丢失的，承担一定责任，可进行适当的赔偿。
法律依据
《中华人民
共和国民法典》 第一千一百六十五条 行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。依照法律规定推定行为人有过错，其不能证明自己没有过错的，应当承担侵权责任。
《工资支付暂行规定》
第十六条 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
第十八条 各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有下列侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金：
(一)克扣或者无故拖欠劳动者工资的;
(二)拒不支付劳动者
延长工作时间工资的;
(三)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的。经济补偿和赔偿金的标准，按国家有关规定执行。
