离婚后，房子归男方，但房产证没下来，现在要办房产证，但女方不配合，要是起诉，法院会如何处理

应当根据离婚协议的约定事项办理的。

根据《婚姻法》及最高人民法院《关于人民法院审理离婚案件处理财产分割问题的若干具体意见》(以下简称《财产分割意见》)的规定，结合司法实践，人民法院在审理离婚案件分割夫妻共同财产时，应当遵循以下原则:一、男女平等原则。二、照顾子女和女方利益原则。三、有利生活，方便生活原则。四、权利不得滥用原则。五、夫妻一方所有的财产，在共同生活中消耗、毁损、灭失的，另一方不予补偿。

(1)婚前由一方承租的公房，婚姻关系存续5年以上的，离婚时，另一方有权要求分割公房权益。注意，这里一方取得的时间是在婚前，如果一方是在婚后取得的，不论时间长短，另一方均有权要求分割公房权益。(2)婚前一方承租的本单位公房，离婚时，双方均为本单位职工的，也就是说，虽然夫妻双方结婚不到五年，但调到同一个单位的，另一方也可以要求分割公房权益。(3)一方婚前借钱投资建房并取得公房承租权，婚后夫妻共同偿还借款的，虽然公房所购时间为婚前，但由于婚后双方共同还款，另一方也有权要求分割公房权益。当然，这里还有不清楚的地方，如婚后共同偿还了多少钱，另一方才有权提出该要求，是一部分还是全部，司法解释没有规定，实践中由法院根据案情酌情处理。(4)婚后一方或双方取得公房承租权的，无论谁是承租人，另一方均有权分割公房权益。(5)婚前一方承租的公房，婚后因该承租房屋被拆迁而重新取得房屋承租权的，虽然房子是婚前一方承租的，但只要婚后遇到拆迁又换了公房，新公房的使用权益就是两个人共有的。(6)夫妻双方单位投资联建或联合购置的共有房屋。(7)夫妻一方将其承租的本单位公房，交回本单位或交给另一方单位后，另一方单位另给调换公房的，也就是说，婚后调换的公房，使用权也是双方共有的(8)婚前双方均租有公房，婚后合并调换公房的。(9)其他应当认定为夫妻双方均可承租的情形。这是个弹性条款，法院有自由裁量权，当法院认为将公房承租权仅判给一方显失公平，或有其他严重不妥的后果时，就可以根据该条酌情处理。