请问我现在在某中心医院住院为什么合作医疗不给报销，还得样我去县医院办理备案手续呢

这是医保机构的规定，咨询医保机构。。。。

1、由所在单位按照本单位因公出差伙食补助标准的70%发给住院伙食补助费。　　2、经医疗机构出具证明，报经办机构同意，工伤职工到统筹地区以外就医的，所需交通、食宿费用由所在单位按照本单位职工因公出差标准报销。　　相关知识延伸阅读：工伤医疗费的报销问题　　1、工伤医疗费报销问题　　职工在工伤认定后，其发生的工伤医疗费用，凭工伤认定结论、出院小结复印件(包括：出入院日期、入院主诉、现病史、检查、诊断、治疗、手术经过、治疗后转归情况、出院注意事项。加盖就诊医院章)、医疗费用明细清单(包括：药物、检查、治疗、手术、化验等每项的名称、用量、次数，单价，每项总价)、有效报销单据(有财政部门监制章或税务部门监制章和就诊医院收费专用章)，由单位到医保经办机构(审核一部)申请报销。　　2、个人医药费用报销的问题　　工伤职工报销个人医药费用的范围：已备案的驻外人员、异地定居工伤人员在自己选择备案的协议医疗机构治疗工伤的费用;经批准转到协议医疗机构以外就医的费用;工伤职工国内探亲或在外地旧伤复发治疗(只能在非营利性医疗机构)的费用;因公出差期间因工伤所致的急诊、急救的费用。　　报销个人医药费用须报送下列资料：转诊转院审批手续，参保单位的探亲、出差证明或相关医院的证明，出院小结(包括：出入院日期、入院主诉、现病史、检查、诊断、治疗、手术经过、治疗后转归情况、出院注意事项。加盖就诊医院章)、医疗费用明细清单(包括：药物、检查、治疗、手术、化验等每项的名称、用量、次数，单价，每项总价)、有效报销单据(有财政部门监制章或税务部门监制章和就诊医院收费专用章)，由单位到医保经办机构(审核一部)申请报销。

报销时需携带以下资料：
　　1.身份证或社会保障卡的原件；
　　2.定点医疗机构专科医生开具的疾病诊断证明书原件；
　　3.门诊病历、检查、检验结果报告单等就医资料原件；
　　4.财政、税务统一医疗机构门诊收费收据原件；
　　5.医院电脑打印的门诊费用明细清单或医生开具处方的付方原件；
　　6.定点药店：税务商品销售统一发票及电脑打印清单原件；7.如果是代人办理则需要提供代办人身份证原件。
报销流程：
　　带齐以上资料到当地社保中心相关部门申请办理，经审核，资料齐全、符合条件的，就可以即时办理。
　　申请人办理门诊医疗费用报销时，先扣除本社保年度内划入医疗保险个人帐户的金额，再核定应报销金额。