法定代表人转款公司账户用于公司经营，会计分录怎么做？

不是法律问题，可以做借款啊。

公章还是应当由法人代表掌控。你们订立公章使用协议也好，作为公司管理制度也好，对你们之间是有效的。但对外可能构成表见代理，法人还是要对外承担责任的，作为法人代表的你还是脱不了干系的。
法人章，实际就是公司法人的个人私章，但必须经过备案，也只有法人企业才有，也就是大家常说的法人个人印鉴，特点是个人性，他一般都保管在公司的财务手中，对外具有一定的法律。
而公司的公章，一般是指公司的在工商部门登记备案企业全称的圆形印章，也就是常说的行政公章，特点是集体性，是对外使用的凭证之一，代表着公司的行为。法人章与公司的公章既有联系，也有区别，两个有时是不能进行代替的。简单的说：公章是代表公司的行为，法人章是与个人相关的个人行为。

法定代表人属于并且通常又具有股东身份，因此公司法定代表人作为股东、发起人或高级管理人员，违反法律规定，则应向本公司或其他第三人承担法律责任。常见情形如下：(一)公司法定代表人作为股东或发起人，未履行按期足额缴纳出资义务的，除应当向本公司足额缴纳外，还应当向已按期足额缴纳出资的股东或按照发起人协议约定承担违约责任。(二)公司法定代表人作为股东，滥用股东权利损害公司及其他股东利益的，应承担赔偿责任。(三)公司法定代表人作为股东，滥用公司法人独立地位和股东有限责任损害公司债权人的利益的，应对公司债务承担连带责任。(四)公司法定代表人作为股东，利用与其他单位的关联关系损害公司利益的，损害公司的，应当向公司承担赔偿责任。(五)一人有限责任公司的法定代表人作为股东，不能证明公司财产独立于股东的自有财产的，应当对公司债务承担连带责任。公司有下列情形之一的，除公司承担责任外，对于公司法定代表人可被处以行政处分(通常为国有企业)、罚款，构成犯罪的，将被依法追究刑事责任：(一)公司超出登记机关核准登记的经营范围从事特定经营活动，非法经营的;(二)公司向登记机关、税务机关隐瞒真实情况、弄虚作假的;(三)股东或公司抽逃资金、隐匿财产逃避债务的;(四)公司解散、被撤销、被宣告破产后，擅自处理财产的;(五)公司变更、终止时不及时申请变更登记和公告，使利害关系人遭受重大损失的;(六)从事法律禁止的其他活动，损害国家利益或者社会公共利益的。公司法定代表人的责任师范类规定的，并不是以合同或者其他方式约定就可以避免的。