公司在新三板挂牌的一个重要目的，是使公司股份能够更自由地变现，这也是很多投资人认购拟新三板挂牌公司股份的重要原因。但新三板公司毕竟与上市公司不同，新三板交易有在股票流通性、交易对象等方面都有限制，如控股股东交易股份有时间限制的规定，违反规定交易股份的，中登公司将不予以登记。倘若要进行新三板交易的，审查自身或对方交易资质，显然非常重要。
新三板交易是指买卖或转让新三板上市公司股份或股票的过程。在此过程中，所有参与者都应该按照新三板交易市场规则来进行股份交易，否则极易发生经济纠纷。如因新三板交易而发生纠纷的，对当事人而言，最好的处理方式就是协商处理，若协商不成的，寻求法律帮助就是最后最有效的选择了。
公司新三板挂牌后，对公司股份转让有一定的限制性规定。
１、控股股东、实际控制人转让公司股份有限制；
２、董事、经理等高管转让公司股东有限制；
３、其余股东转让公司股权没有障碍，只要该股东并非股份公司发起人或虽作为发起人但股份公司设立已经满一年的，该股东股份转让不受任何限制。
协议有效，但存在较大风险。
新三板市场规则，对新三板公司的控股股东、实际控制人转让股份是有特殊限制的，其所持有股票在挂牌之日、挂牌满一年以及挂牌满两年等三个时点可分别转让所持股票的三分之一。但目前，对控股股东、实际控制人违反限售规定签订的股份转让协议是否有效等没有规定，因此，该股份转让协议有效。
此外，在实践中，由于新三板限售规定的存在，股份转让往往只能在限售期结束后才能办理股权登记，从而导致了较大违约风险。需要购买的，建议先咨询专业中小企业律师，尽可能剔除潜藏的法律风险。
目前新三板交易规定，对新三板公司员工转让股票没有限制，只要该员工股东并非股份公司发起人或虽作为发起人但股份公司设立已经满一年的，随时可以进行新三板交易，转让公司股票。
但如果员工与公司签署入股协议，对股份转让有相应约定的，要遵循协议约定，否则需要承担相应的违约责任。例如协议上明确要求离职时退还股票或有禁售期约定，则按照协议执行，不可以转让股票。
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在新三板交易中，发生股权纠纷的，应该到股权转让协议履行地或被告所在法院进行起诉。只是起诉后，想要胜诉，就需要有充分的证据、专业的法律知识及良好的庭审技巧，但一般人往往玩不转，建议最好委托专业经济纠纷律师协助处理，尽最大可能维护自身合法权益。
新三板挂牌公司出现以下情形之一的，全国股份转让系统公司可以终止其股票挂牌：
（１）中国证监会核准其公开发行股票并在证券交易所上市，或证券交易所同意其股票上市。
（２）终止挂牌申请获得全国股份转让系统公司同意。
（３）未在规定期限内披露年度报告或者半年度报告的，自期满之日起２个月内仍未披露年度报告或半年度报告。
（４）主办券商与挂牌公司解除持续督导协议，挂牌公司未能在股票暂停转让之日起３个月内与其他主办券商签署持续督导协议的。
（５）挂牌公司经清算组或管理人清算并注销公司登记的。
（６）全国股份转让系统公司规定的其他情形。
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