建设工程合同纠纷的处理方式有

如果有质量问题，对方施工费用要相应减少

工程欠款的诉讼时效使用一般民事案件的诉讼时效，为三年，从知道或应当知道拖欠行为起算。我国法律规定诉讼时效可以通过一定的主张权利行为得以中断，中断后诉讼时效可以重新计算。因此，各承包商可以采取书面发函(对方一定要签收或采取挂号信等形式证明已送达)、向清欠主管部门及相关部门投诉(一定要有书面记录)、与发包方补充协议或签订还款协议等办法，使诉讼时效中断。

建设工程合同纠纷的解决方案 （1）坚决抵制和杜绝不平等合同。当前的建筑市场虽然是买方市场，但是由于发包方在合同签订中占据主导地位，因此在招投标过程中也占据了明显的优势。作为工程施工的承包方，在工程建设项目的谈判过程中，一定要牢记以平等为前提，充分确保自身权利不受侵犯，同时从源头消除纠纷的发生，与发包方签订合法、合理、有效且不失公允的项目施工合同。 （2）坚持使用和推行合同示范文本。合同是规定甲乙双方当事人权利及义务的基础，建设工程施工合同一旦签订成立生效，双方的权利和义务就此确定。所以，拟定合法、规范和合理的施工合同，就成了避免和减少产生纠纷的重要对策与途径。采取书面形式的订立，才能确保合同的顺利履行和合同内容的确定性。 （3）坚决抵制阴阳合同。《招标投标法》第四十三条规定：“招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起30日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同，招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。”第五十九条规定：“招标人与中标人不按照招标文件和中标人的投标文件订立合同的，或者招标人、中标人订立背离合同实质性内容的协议的，责令改正；可以处中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款”。因此，只能严格依照招投标文件来订立合法的合同。当施工方被提出阴阳合同这类荒谬要求，必须坚决抵制，从而预防和避免合同纠纷。 （4）增强诚信，提升合同的履约度。针对现状，必须在履行合同过程内以诚信为本。为了预防、避免和减少施工纠纷的发生，应当建立诚信体系，致力于提高施工合同的履约程度，以此来逐渐规范和完善建筑市场，使其能够良性运行。 （5）法院多措施处理好工程合同纠纷案件。严格依规定审理合同纠纷，严格尊重双方当事人的“意思自治”。实践中应当按照《解释》第十二条的规定承担过错责任。通过相互协调了解，有效的防范建筑市场违法违规操作的发生。