你好！ 即使向公司申请试管移植的休假也没有被批准，2个月后怀孕了。 这种情况的单位在没有怀孕之前，以你不同意请假为理由辞职是合法的吗？

劳动者请事假的，用人单位有权不批准，未经批准擅自离岗的，用人单位有权按旷工处理。但用人单位只能扣除该旷工三天的工资，不能扣除之前两个月的工资。

用人单位存在克扣工资的，劳动者可向劳动保障行政部门（劳动监察大队）投诉，由劳动监察大队责令限期支付，逾期不支付的，可以请求加付赔偿金，赔偿金标准：应付金额百分之五十以上百分之一百以下。
投诉时，应提供本人身份证复印件以及相关拖欠工资的证据。

或者向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。申请时应当提交书面仲裁申请书（2份）；证据清单和相应证据材料（2份），证据材料主要有劳动合同，工资银行账单；身份证复印件（1份）。

法律依据：《劳动法》
第五十条工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

《劳动合同法》
第八十五条　用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿;劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分;逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：
(一)未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的;
(二)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的;
(三)安排加班不支付加班费的;
(四)解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。

《劳动争议调解仲裁法》
第五条发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。

在正常情况下，用人单位不得辞退孕期女职工。这是对女职工最基本的权益保护。《劳动合同法》规定：第四十二条劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同：
(一)从事接触职业病危害作业的劳动者未进行离岗前职业健康检查，或者疑似职业病病人在诊断或者医学观察期间的；
(二)在本单位患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的；
(三)患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的；
(四)女职工在孕期、产期、哺乳期的；n
(五)在本单位连续工作满十五年，且距法定退休年龄不足五年的；
(六)法律、行政法规规定的其他情形。

劳动法规定单位是不可以克扣工资的，若女工怀孕期间请假并没有产生劳动情况下，请假时间扣除当天工资是合法的，但是不可以以任何理由扣除其他工资。

　　《中华人民共和国劳动法》
　　第九十一条　用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
　　
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的
　　
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；
　　
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的
　　
（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。