笔迹鉴定程序如下：
1、由一方当事人在举证期前向法院提起申请；
2、经过双方当事人质证，确定提供鉴定的样本；
3、由双方协商选定或摇号选定鉴定机构；
4、鉴定机构接收后鉴定申诉后，凭借自己专业技术及依法做出鉴定意见；
5、双方当事收到鉴定意见后对鉴定结论有异议的，还可以申请重新鉴定。
《司法鉴定程序通则》第九条
司法鉴定机构和司法鉴定人进行司法鉴定活动应当依法接受监督。对于有违反有关法律、法规、规章规定行为的，由司法行政机关依法给予相应的行政处罚；对于有违反司法鉴定行业规范行为的，由司法鉴定协会给予相应的行业处分。
