病假期间是会扣一定的工资的。病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，不能低于最低工资标准的80%。职工全年月平均工作天数和工作时间分别调整为0.9天和67.4小时，可以照此折算出员工日平均工资。职工请事假(含病假)期间的工资待遇，国家机关、事业单位实行照发工资的制度。
劳动部劳部发[201415印发《实施〈劳动法〉中有关劳动合同问题的解答》的通知规定：
病假期间员工工资的发放标准：连续医疗期间在6个月以内者本企业工龄不满2年者，为本人工资60%；已满2年不满4年者，为本人工资70%；已满4年不满6年者，为本人工资80%；已满6年不满8年者，为本人工资90%；已满8年及8年以上者，为本人工资100%。连续医疗期间超过6个月时，根据劳动保险条例第十三条乙款的规定，病伤假期工资停发，改由劳动保险基金项下，按月付给疾病或非因工负伤救济费，其标准如下：本企业工龄不满1年者，为本人工资40%；已满1年未满3年者，为本人工资50%；3年及3年以上者，为本人工资60%。
