股东的股权被司法冻结后，的确会导致公司无法行使部分权利，但是被限制的权利仅仅是股权的转移和股息或红利的支付，并未限制公司注销登记的权利，所以股权冻结工商能注销。
根据《最高人民法院关于人民法院执行工作若干问题的规定》
第53条：对被执行人在有限责任公司、其他法人企业中的投资权益或股权，人民法院可以采取冻结措施。
冻结投资权益或股权的，应当通知有关企业不得办理被冻结投资权益或股权的转移手续，不得向被执行人支付股息或红利。被冻结的投资权益或股权，被执行人不得自行转让。
第54条：被执行人在其独资开办的法人企业中拥的投资权益被冻结后，人民法院可以直接裁定予以转让，以转让所得清偿其对申请执行人的债务。
人民法院也可允许并监督被执行人自行转让其投资权益或股权，将转让所得收益用于清偿对申请执行人的债务。
