朋友委托我代替甲方签订二手车私下交易协议，最后时间过了过户时间，我签订的违约金两千元，乙方不愿意协调，我该怎么办呢

你只是委托人，结果由本人承担。

1、依据当事人是否有约定违约金，分为约定赔偿和法定赔偿
约定赔偿包括两种情形：当事人在合同约定赔偿的条款，另一种是合同没有约定，但合同成立后达成赔偿的协议。
2、约定赔偿
指合同当事人在订立合同时，预先约定一方违约产生的赔偿额的计算方法或向对方支付一定的金钱。
由于损失的范围在合同订立时难以确定，因此，当事人在合同中只能约定赔偿的计算办法，而不宜约定一个固定的赔偿数额。赔偿可以用金钱货币形式确定，也可以用非金钱方式确定。
3、法定赔偿
指在当事人一方违约造成对方损失时，按照法律规定的办法计算赔偿额进行赔偿。
这里所说的法律，既包括合同法，也包括有关合同违约赔偿的其他法律法规规定。
法定赔偿方法一般是在当事人没有事先约定赔偿或者违约金的情况下运用。
在法定情况下，法律不仅规定了违约赔偿的条件、范围，也规定了赔偿的计算办法等。

　　　　协议书更有法律权威。　　协议书有广义和狭义之分。广义的协议书是指社会集团或个人处理各种社会关系、事务时常用的"契约"类文书，包括合同、议定书、条约、公约、联合宣言、联合声明、条据等。狭义的协议书指国家、政党、企业、团体或个人就某个问题经过谈判或共同协商，取得一致意见后，订立的一种具有经济或其它关系的契约性文书。协议书是应用写作的重要组成部分。　　协议书是社会生活中，协作的双方或数方，为保障各自的合法权益，经双方或数方共同协商达成一致意见后，签定的书面材料。协议书是契约文书的一种。是当事人双方(或多方)为了解决或预防纠纷，或确立某种法律关系，实现一定的共同利益、愿望，经过协商而达成一致后，签署的具有法律效力的记录性应用文。　　订立协议书，其目的是为了更好地从制度上乃至法律上，把双方协议所承担的责任固定下来。作为一种能够明确彼此权利与义务、具有约束力的凭证性文书，协议书对当事人双方(或多方)都具有制约性，它能监督双方信守诺言、约束轻率反悔行为，它的作用，与合同基本相同。口头协议一律无效;书面协议有三种形式，即合同中的条款、独立的协议书及信函、电报、传真、电子邮件等其他书面形式。　　委托书是委托他人代表自己行使自己的合法权益，委托人在行使权力时需出具委托人的法律文书。而委托人不得以任何理由反悔委托事项。被委托人如果做出违背国家法律的任何权益，委托人有权终止委托协议，在委托人的委托书上的合法权益内，被委托人行使的全部职责和责任都将由委托人承担，被委托人不承担任何法律责任。　　在诉讼中，是指委托代理人取得诉讼代理资格，为被代理人进行诉讼的证明文书，其记载的内容主要包括委托事项和代理权限，并由委托人签名或盖章。但在其他民事法律行为过程中，也可能存在有授权委托的法律文书。在，这类委托书会以契约形成，将个人的某些权力，委派于他人身上。最常见的是用于物业管理上，例如业主已移民外国，业主在港的物业，他委派一个可信的人替他管理，亦可以透过委托书要求受委托人替他将物业出租或出售。